মেমব্রেন সিস্টেমটি ডিজাইনের ভিত্তি হিসাবে অবিচ্ছিন্ন অপারেশনের উপর ভিত্তি করে, তবে প্রকৃত অপারেশনে, সর্বদা স্টার্টআপ এবং শাটডাউনের একটি নির্দিষ্ট ফ্রিকোয়েন্সি থাকবে।
মেমব্রেন সিস্টেম বন্ধ হয়ে গেলে, উচ্চ ঘনত্বের কিন্তু ঝিল্লি উপাদান থেকে স্কেল ইনহিবিটর ধারণ করে ঘনীভূত জলকে প্রতিস্থাপন করতে কম চাপের ফ্লাশিংয়ের জন্য পারমিট ওয়াটার বা প্রিট্রিটেড ওয়াটার ব্যবহার করতে হবে। সিস্টেম থেকে জল বেরিয়ে যাওয়া এবং বাতাসের প্রবর্তন থেকে জল রোধ করার ব্যবস্থাও নেওয়া উচিত, কারণ উপাদানটি জল হারায় এবং শুকিয়ে গেলে পারমিট ফ্লাক্সের একটি অপরিবর্তনীয় ক্ষতি হতে পারে।
যদি ডাউনটাইম 24 ঘন্টার কম হয়, তবে জীবাণু বৃদ্ধি রোধ করার জন্য কোন ব্যবস্থার প্রয়োজন হয় না। যাইহোক, যদি ডাউনটাইম উপরে উল্লিখিত বিধানগুলিকে অতিক্রম করে, তবে সিস্টেম সংরক্ষণের জন্য প্রতিরক্ষামূলক তরল ব্যবহার করা উচিত বা ঝিল্লি সিস্টেমকে নিয়মিত ফ্লাশ করা উচিত।
